随着王允、吕布成功地诛杀董卓，位于长安的东汉朝廷总算结束了董卓乱政时期的混乱，得到了暂时的安定，朝政大权也从董卓的手里转入了王允、吕布的手里，王允俨然成为百官之首、天子之下的第一臣，吕布俨然成为武将之魁、天下汉军的最高指挥官，不过，这只是在名义上的，被王允、吕布把持掌控的天子和长安朝廷的实际控制地区只是以长安为核心的关中地区，即司州西部、凉州东部等，除此之外，天下十分之九的地区已经陷入了诸侯并起、群雄割据、军阀混战的状态中。王允、吕布在铲除董卓、把持朝政后为竖威施恩，拉拢天下诸侯，特地以天子的名义对各路诸侯大加封赏了一通，特别是在讨董之战中表现突出、立功较大的。王允和十八路诸侯都是反董的，堪称属于同一战线，王允十分乐意做一个顺水人情：
加封袁绍为冀州牧、大将军——王允此举是代表东汉朝廷默认袁绍吞并、割据冀州之举，给了袁绍一个正式的政治名分；
加封袁术为骠骑将军（原骠骑将军是卢植，现已辞官）、扬州九江郡太守；
加封曹操为司隶校尉、车骑将军（原车骑将军是何苗，已死；另，皇甫嵩是左车骑将军，朱儁是右车骑将军，二人现俱已辞官）；
加封刘表为荆州牧、前将军（刘表原为荆州刺史）；
加封公孙瓒为幽州刺史、后将军（幽州牧是刘虞）；
加封陶谦为徐州牧（陶谦原为徐州刺史）；
加封孙坚为豫州刺史（原豫州刺史孔伷现已病逝）、卫将军；
加封韩遂为凉州刺史，加封马腾为左将军——王允此举是安抚韩遂和马腾，让他们不要再攻打属于长安朝廷实际控制地区的凉州东部了，毕竟，韩马二人以前攻打凉州东部是打着讨伐国贼董卓的大义旗号的，如今，董卓已死，韩马二人自然没有正当理由攻打凉州东部了；
加封孔融为青州牧（孔融原为青州刺史）、右将军、鲁侯，同时批准把泰安郡（泰山郡）划出兖州，划入青州，使得青州六郡增为青州七郡——王允此举是对孔融投桃报李。在政治法理上，孔明可以割据青州和鲁国，但他占据属于兖州的泰安郡（泰山郡）是“非法”的（孔明必须占据泰安郡，否则青州和鲁国就要被分隔开来），王允顺水推舟，把泰安郡（泰山郡）从兖州划入了青州，归入孔融治下领地，使得孔明从此便能名正言顺地拥有泰安郡（泰山郡）。
另外，孔融从青州刺史变成青州牧，权力得到了进一步的扩大，青州刺史在法理上只能掌握青州的政权，青州牧在法理上则能掌握青州的军政两大权，可以名正言顺地“割据一州、拥兵自重”，拥有在州内自由任免各级官吏的权限。
一时间，各路诸侯纷纷欢喜不已，众诸侯与长安朝廷的关系得到了极大的改善，双方“相敬如宾”。长安朝廷在正统名分上仍是天下共主，受到各路诸侯的承认和在名义上的尊奉（如果不承认长安朝廷，自然就没法戴上长安朝廷送来的官帽），从而偏安一隅地坐享关中地区，至于关东各路诸侯，袁绍、袁术、曹操、韩遂、马腾、公孙瓒、公孙度、刘虞、刘繇、刘岱、刘焉、刘表、刘宠、孙坚……尽皆在忙着争抢地盘、扩充实力。除了关中地区，天下一片混乱。此局势，极其酷似东周末年——周天子在名义上是天下共主，但周天子真正控制的地盘只占天下的一小部分，天下绝大部分地区被春秋五霸、战国七雄互相分割占据并且互相攻伐不休，如今的汉天子也是如此。
孔明没有像别路诸侯那样急不可耐地争抢地盘，拥有青州七郡（齐、济南、北海、平原、乐安、东莱、泰安）和鲁国，他已经十分满足了，这倒不是因为他“小富即安”或没有大志，而是因为他知道：抢地盘容易，治地盘难。青鲁二地合计86个县、约10万平方公里的土地、超过600万人口，需要对其进行精心治理、经营、建设、发展、开发。正所谓“贪多嚼不烂”，孔明接下来要把精力投入治理青鲁二地，而不是争抢更多的地盘。
青州牧是孔明的爹孔融，鲁国相是孔明的三伯孔谦，鲁县令是孔明自己，毫不夸张地说，青鲁二地完全就是孔家的，虽然这种人事安排带着浓浓的“任人唯亲”和“家天下”的味道，但此况也有好处：十分便于孔明做事。孔融也好，孔谦也好，还有孔明，都是孔家人，自然一家人一条心，不存在什么勾心斗角、派系纷争；另一方面，几年下来，不但孔明的部下们对他死心塌地、敬若天神，就连孔融、孔谦等孔明的家中长辈也对他“敬畏有加”，可以说，孔明一发话，孔融、孔谦等孔家长辈都会服从。说到底，孔融能先后当上青州刺史、青州牧、右将军以及被封为鲁侯都是托了孔明的福。
孔明第一个治理的自然是军队。
孔明的军队已经从“鲁军”升级为“齐鲁军”（青州为“齐”，鲁国为“鲁”），军士人数也从2万余人扩增至6万余人，其中，步兵约4.5万人，骑兵约1万人，水兵约5000人（主要在黄河上、近岸海域内活动）。为了进一步地加强齐鲁军的正规化建设，孔明毫不犹豫地把后世的那套先进的军事编制用在了此时的齐鲁军的身上，齐鲁军以“营”为基本战术部队：
十名军士为一班，班内设正副班长各一人；
三班为一排，排内设正副排长各一人，一排合计三十多名军士；