在西元185年、186年、187年、188年的这四年间，孔明埋头潜心发展，他一边使尽浑身解数地赚钱敛财，一边花钱如流水，被他花掉的钱十有七八用在了鲁军的身上，他心里再清楚不过了，天下即将全面大乱，拥有一支战斗力强劲的军队是一切的根本，如果连自保能力都没有，任何宏图大计都是空中楼阁。为了进一步地提升鲁军的战斗力，孔明费尽心思，独具匠心地给鲁军设计了军旗。
鲁军的军旗为矩形，底色采用绿色，一边是一轮红色的太阳，另一边是一弯黄色的月亮，中间是一个粗黑的“漢”字，之所以在军旗上绣有日月，乃源于汉宣帝的那句“凡日月所照、江河所至，皆为汉土”豪言壮语，旨在鼓励鲁军将士们把汉家儿郎的尚武勇战精神发扬光大；另一方面，日和月合在一起就是孔明的“明”；这面军旗被称为“日月军旗”或“日月战旗”。
既有军旗，就有军歌。鲁军的军歌自然也是由孔明谱写的，实际上，华夏古代各朝军队都有自己的军歌，但格调普遍悲壮沉重，比如《国殇》、《岂曰无衣》、《风萧萧兮易水寒》等，充满“军人有去无回”的悲剧色彩，孔明觉得，真正的军人和有意义的、有价值的战斗都是伟大的，军歌没必要悲壮沉重，应该雄壮豪迈，充满了勇气和希望。出于这样的思想，孔明谱写出了一曲《汉家儿郎》，歌词如下：
汉家儿郎兮，顶天立地，
保家卫国兮，杀敌剿贼；
披我战甲兮，离我家乡，
握我战刀兮，别我父母；
踏上征途兮，无所畏惧，
同仇敌忾兮，建功立业；
衣锦还乡兮，封妻荫子，
光宗耀祖兮，不负父母。
同时，孔明给鲁军制定了“五大军纪”，分别是：
一、身为大汉将士，应当保护大汉百姓，不得伤害大汉百姓；
二、坚决服从上官命令，严格执行上官命令；
三、一切缴获都要上交，上官自会论功行赏，不得私吞私藏；
四、在撤退、转移时必须带走所有的受伤同伴和战死同伴，不得抛弃同伴；
五、必须爱护自己的武器装备，平时不得损坏，战时不得丢弃，人在武器装备在，如果在紧急情况下实在无法带走武器装备，必须将其彻底地毁坏，坚决不得使其落入敌方手里。……
孔明搞出的这些东西无疑具有诸多方面重大意义的创举，让孔融、刘备、臧洪、太史慈、武安国等人无不深感新奇，随即，事实证明孔明的这些举措确实产生了很好的效果，大大地振奋了士气和军心，同时也强化了士卒们的战斗力和军纪，提升了士卒们的荣誉感和责任感。
在这四年间，鲁国一片太平，但在大汉别地，则是风波战乱不断。
西元185年二月，洛阳发生火灾，部分皇宫被毁，汉灵帝在中常侍张让、赵忠等人鼓动唆使下昭告全国，下旨增加田亩赋税，向各州郡征集奇石良木，以用于修建皇宫，大批宦官、官吏趁机中饱私囊、横征暴敛，极大地增加了民众的负担，以致于全国各地民怨沸腾、民不聊生，同时，汉灵帝认为黄巾之乱已被平定，自己可以高枕无忧地享乐了，于是愈发地穷奢极欲，建造万金堂，将国库财物移入其中作为个人私财，并且公然地以极高的价格卖官鬻爵，强迫各地各级官员向其上交钱财，很多清廉官员被迫辞职甚至自杀，更多的贪官污吏则为了弥补自己的损失而变本加厉地搜刮百姓。全国各地民变蜂起，各路起义军形成野火燎原之势；
三月，凉州叛军头目北宫伯玉、李文侯、王国、宋建等打着“清君侧”旗号，进逼司州，汉灵帝派遣左车骑将军皇甫嵩、司隶校尉张温、破虏将军董卓、荡寇将军周慎等人征讨叛军，同时，凉州刺史耿鄙征调官兵、招募勇士讨伐叛军，马腾从军加入其部，由于耿鄙不得人心，军队在途中发生哗变，耿鄙死于乱军中，马腾率领一批士卒兵马投奔了叛军；
九月，太尉杨赐病逝。孔融、刘备离开鲁国，前往洛阳吊丧。
西元186年，十常侍之一毕岚发明了翻车和虹吸管，孔明得知此事后派人前去洛阳取来翻车样品交给马钧研究，马钧在其基础上进行改进，研制出了灌溉农具“龙骨水车”，孔明指示把龙骨水车向鲁国全境进行推广，各个农村被免费赠送和安装，大大地促进了农业生产；
二月，荆州江夏郡军士赵慈起兵反叛，攻破六个县城，袭杀荆州南阳郡太守秦颉；
十月，荆州武陵郡土著蛮人起兵反汉。
西元187年二月，司州荥阳县民众起义，起义军攻占中牟县，斩杀县令落皓、主簿潘业；