“陛下，来自广东的奏章。”自从魏忠贤辞官后，张彝宪就成了司礼秉笔首监，代替魏忠贤，替朱由检掌管玉玺，传送大臣们的奏章。张彝宪为人不像魏忠贤那样会揣摩圣意，也不像徐应元那样八面玲珑，儿时忠厚得近乎木讷，惟其如此，朱由检才放心地将玉玺让他掌管。
朱由检暂时撤销内阁，在他的改革中少了一份阻力，但没有内阁批阅奏章，朱由检必须亲自批阅。
不过朱由检将奏章进行分类，根据奏章的具体内容，由六部尚书们分别处理，他们只有遇到不能解决或者不能决定的事，才会将奏章送给朱由检。
“彝宪，什么事？尚书们不能处理吗？”
“陛下，尚书们说，他们做不了主，希望陛下明示。”张彝宪将一沓奏章递给朱由检。
奏章一共有两封。
一封是两广总督的奏章。兵部命令在广州组建南海舰队，但大明的海军已经颓废多年，南方已经没有能出海的船只，也没有会训练海军的人才。
另一封是广东巡抚的奏章。南直隶人徐光启，在广州私开学馆，招收童生，学习洋＠，文，推广天主教。
“徐光启？”朱由检默默念叨着，这可是大明最著名的科学家、数学家、军事家、农学家和水利专家，不但翻译了西方的数学论著《几何原本》，还引进了物理、化学、地理等学科，自己打着灯笼都找不到的人，如果不是广东巡抚的奏章，自己竟然将他完全忘记了。
“彝宪，立即回乾清宫。”朱由检已经没有了玩邂逅的兴致，他快步在前，回到乾清宫。
朱由检独自在上书房来回踱步。
南海舰队的事不难解决，没有船只，可以制造，让李春烨将制造大宝船的图纸找出来，也可以从沿海的商人手中购买；没有熟悉海军的官员，可以让登州的北海舰队适当支持，登州的海军已经秘密组建了两年半，应该有一些富余的人才。
关键是徐光启。
大明刚刚开始羽化，像徐光启这样的科技人才太宝贵了，怎么才能将他身上的能量，最大限度地挖掘出来，让大明拥有千千万万个徐光启……
学校。
朱由检猛然一悟。
这是大批量培养人才最快捷的方式。
朱由检迅速在脑中盘算着，内阁已经撤销，六部已经摆平，问题是兴办学校所需要的条件。
首先是教员。徐光启在广州私开学馆，应该有一批教员，还可以从各地的传教士中聘请一批，再从国内网罗一批像徐光启那样的孤独的科技爱好者。
其次是场地。现在从零开始修建一所学校，时间太久，不如直接购买一所宽阔的房子，适当改造，作为学校，万一不行，还可以将宫中闲置的殿堂拿出来，特别是后宫，现在东西六宫都是闲置的。
再次是教材。上课需要专用的教材，这些必须交给徐光启这样对科技有一定认识的人，必要的时候，朱由检准备亲自参加对教材的审定。
最后是学员。大明有大量的落第秀才和不得志的举人，让他们进学校学习，不仅可以促进大明科技的发展，也能为他们找到一条谋生的道路。不过，朱由检考虑到年龄大的人思想比较僵化，难以接受新鲜事物，暂时将学员的年龄定在二十五岁以下。
朱由检在纸上写写画画，终于敲定了各种草案。本来兴办学校这种是，交给礼部或者国子监更合适，但现在李春烨对朱由检最为了解，也最为理解，所以朱由检准备交给兵部，其它各部在各自的职责范围内全力支持，特别是户部的资金支持。
最后，朱由检命令柳林给广东飞鸽传书两封。
一封给徐光启。
朱由检主张徐光启，带上他的家眷、书籍、人才，甚至是愿意来京学生的学生，由广东巡抚提供车马，立即来京，朱由检保证为徐光启提供最好的办学条件。
另一封给广东巡抚。
朱由检命令他为徐光启安排最好的车马盘资，如果徐光启有个三长两短，或者不愿来京，那他这个广东巡抚也可以致士归田了。
崇祯元年（公元1628年）二月，徐光启一行终于来到京师。
朱由检兑现了承诺，他为徐光启提供了一切便利的条件，工部在京师的东北角，给徐光启找到一所极位庞大的闲置府邸，让徐光启组建大明科学院。
几乎与此同时，新编第七军、第八军整编结束。
四月，新编第一军、第二军、第三军、皇家第一军、皇家第二军整编结束，全面进行实战演习。
五月，新编第四军、第五军、第六军整编结束。
至此，京师军全部整编结束，三十余万军队，整编成十个军，其中皇家第一军、皇家第二军是朱由检的亲军，只受朱由检节制。
六月底，大明科学院正式开始招生，徐光启担任大明科学院的第一任院长。
根据朱由检的意见，科学院设数学班、地理班、化学班、物理班、生物班、医药卫生班等。