就在甲三师、乙六师攻占绥远城的时候，平定了四川全境的甲四师和甲六师，在湖北和云南的地方驻防讨虏军进入四川接管之后，也开始了北上攻占甘肃的征途。
太圣二年九月，梁立泰和罗琼树两人，分别率领甲四师和甲六师，从龙安府北上，攻占甘肃的阶州和岷州和秦州，准备将陕西彻底封锁下来，让还滞留在陕西西安府的满清重兵无法西逃，一举解决西北战事。
虽然满清大势已去，但西北历来是满清重视的边疆纷争区域，向来重兵把守，除西安将军府驻防近五千的满旗八旗兵外，整个陕西，主要是西安府和凤翔府有绿营兵近万人驻守，在由西安将军兼任陕甘总督的扎拉芬以及陕西提督桂明的指挥下，竟然不但没有溃散，还四处招募兵勇，发展兵力，意图紧守西北等地。
讨虏军总参谋部经过分析，发现整个西北地区，陕西的残余清兵还有近二万人，大部分集中在西安府和凤翔府，而甘肃兵力薄弱，新疆却虽然地广人稀，但因是边疆之地，在乾隆晚期发生过多次叛乱后，便重兵驻守，平定准噶尔部及南疆大小和卓叛乱之后，仍留有伊犁四营和两个满营驻守在伊犁等地。如今因为满清灭亡，兰州发往新疆的粮食和兵饷断绝，导致众多的内地清兵纷纷从新疆逃回陕甘等地，叶尔羌、库车等地的清兵便一逃而空，不过，就算是这样，伊犁仍旧有锡伯营和察哈尔营以及两个满洲营，一共万余人，加上塔城和南疆的少量八旗兵，仍有近一万五千兵力，并且，这部分兵力是苦寒之地的久战老兵，十分骁勇，加上又是边疆，一时间根本难以攻占。
因此，讨虏军总参谋部采取的战略便是派遣在四川的两个师，直接由四川攻入甘肃，占领兰州、凉州一带通往边疆的通道，将陕西和新疆的清兵彻底切断开来。
事实上，讨虏军还真做到了。
甲四师和甲六师二队人马，进入甘肃后，一路几乎未遇到任何抵抗，一路收纳归顺的零星清兵和地方团练，收集战马，改步行为马上步兵，经过月余，占领秦州和兰州、凉州等地，除了北方的甘州、肃州和东北的宁夏府等地外，其余的兵家重地均占领下来。
而与此同时，占领山西的讨虏军，除留乙六师和义一师驻守山西外，甲三师、和乙三师，再加上山西河南招募的三万新兵，相继攻入陕西北部的榆林府、绥德州和延安府等地，重兵压向西安城，准备一举攻占陕西。
正在这时，谁也想不到的一场变故发生了。
陕西西安府渭南县赤水镇，一伙从河南蒲州府等地边界逃窜过来的满汉清兵三四百余人，又累又饿，便起了心思，逼迫赤水镇的百姓献出吃食和钱财，作为补给。但没想到的是，赤水镇的百姓均姓马，是为同族，竟然异常的团结，只同意给吃食，不给钱财。
于是，这伙从河南来的满清逃兵饿急了眼，仗着武力，杀入赤水镇，屠杀百姓数十人，大吃一顿后，抢劫财物后大摇大摆继续赶往西安城。
赤水镇附近的百姓向渭南县衙报官，同时央求地方团练进行堵截逃兵，捉拿问罪。这时，这帮满清逃兵想着这陕西还是大清的天下，便直接也跑到渭南县城，说赤水镇的百姓全部已经与讨虏军勾结，意欲造反，要求官府速速增兵剿洗。