1998-2006
在1998-2006年其间，索马里境内有不少地区发出独立宣言。不过这些地区，不像索马里兰宣告脱离索马里，他们只是想要自治。
在1998年，邦特兰宣布“临时”的独立，并表示它将会参加任何索马里的和解调停，组成新的中央政府。同年，南方的朱巴兰也宣告独立。
2006年12月25日第三支自我宣告独立的组织是1999年成立的拉汉文抵抗军（rra），此组织活动地区是延著邦特兰的边界沿线一带。这次rra“短暂”的分离行动、于2002年再一次宣告。接着就有索马里西南国的独立出现。在1999年、rra早就已经对索马里中央及南部地区拜州及巴科勒州进行行政上的独立自治。而朱巴兰（jubaland）地区显示出被索马里西南国所围绕，也因此她的政治地位到目前为止还不明朗。
第四支自我宣告独立的组织、是2006年由贾穆杜格（galmudug）针对联合伊斯兰法庭（icu）的武装力量的增强所发布的。索马里兰也被许多索马里人视为一个自治政府实体，纵然这些索马里兰人背离索马里人走向另一条宣布完全独立的道路。
而在1998到2006年这段期间，也出现不同的军事调停行动会议、目的是为针对各方武力消长所推出来的方案。这些调停行动会议比如：泛部族间的过渡国家政府、及索马里和解与恢复委员会（srrc）等，这些调停组织最终也打下了在2004年11月所建立的索马里过渡联合政府的基础。然而、在这段期间军阀及部族间的暴乱冲突仍然持续著，而这时所谓国家政府军事力量的控制能力也是稍微可以及于索马里的各地区。
第四阶段
2006-2009
于2004年，索马里过渡联合政府建立于肯尼亚内罗毕，暂定阿卜杜拉希?优素福?艾哈迈德为临时总统，2005年1月正式成立，此后根据地移至索马里的拜多亚。
同时在2006年的初期，出现一支名为恢复和平与反恐联盟（arpct）的组织，它是由非宗教性的且以摩加迪沙为基地的军阀所组成的武装团体。arpct组织反对以沙里亚法规为导向的联合伊斯兰法庭的揭起，其时icu已经在快速的强化武装力量当中。在arpct方面，得到来自美国cia的金援。 也因如此、整个地区情势的发展严峻起来，进一步地导致首都地区的冲突不断提升。
至2006年6月，icu于摩加迪沙战役成功的夺取首都摩加迪沙，并将arpct逐出摩加迪沙。跟着成功的说服、或以武力强迫其他的军阀加入他们这一派。在他们打到邦特兰边界地区以及接收朱巴兰南区及中区之后，icu的武力地盘逐渐扩大。
伊斯兰基本教义派的行动不断的增强武装力量，而且伊斯兰好战份子不断的领军扩大参与介于伊斯兰基本教义派与索马里其她派系间的军事冲突，其她派系包括索马里过渡联合政府、邦特兰以及贾穆杜格，后者的这些派系组成自治政府、其目的特别是要来抵抗伊斯兰基本教义派组织的武装攻击。如此严峻的情势、也导致埃塞俄比亚的介入，埃国的立场是支持非宗教性的索马里武装组织。icu也声称获得埃塞俄比亚的对手厄立特里亚及外国伊斯兰圣战者（mujahideen）的支持、而对埃塞俄比亚进行圣战宣告，圣战主要还是针对埃塞俄比亚占领了索马里的盖多州、及在拜多亚周围地区布置军队的军事行动而发起。
联合伊斯兰法庭对埃塞俄比亚介入的战斗及溃败于2006年12月，icu与tfg开展拜多亚战役。战斗延烧到索马里的穆杜格州地区的城镇班迪拉德里与希兰州地区的城镇贝兰德文等地方。icu主要作战目的是用军事武力将埃塞俄比亚武装部队逐出索马里领土之外。然而，icu在所有的主要战役均被击败，接着被迫撤出摩加迪沙。在12月27日乔哈尔战役中经过最后短暂的战斗之后，icu的领导随后就退位。
紧接着吉利布战役在2006年12月31日开打，奇斯梅耀于是在2007年1月1日就落到tfg及埃塞俄比亚武装部队的手里。总理阿里?穆罕默德?盖地（ali mohammed ghedi）呼吁全国进行解除武装运动。
第五阶段。
于2009年1月，埃塞俄比亚武装部队撤出索马里，留下风雨飘摇的索马里过渡联合政府、及结盟军阀、跟一支几千人组成的非洲联盟分遣队，由这些杂凑部队建立起一个民族国家。随着埃塞俄比亚武装部队的撤出战区，索马里南半部地区很快的就落入激进的伊斯兰基本教义派叛军如prm、伊斯兰党等组织的手里。叛军迅速的在几个省份击溃tfg政府军及非洲联盟部队，在叛军控制下的地区就实行沙里亚法规。叛军攻击首都摩加迪沙，也夺得首都大部分地区不过还是没有推翻tfg政府，而tfg政府仍就控制着首都几平方公里的地区。
2010年3月12日索马里政府军在非洲联盟驻索马里特派团部队的火力支援下和反政府武装组织在首都摩加迪沙持续地进行战斗，自10日以来已造成约60人死亡。 两百多名重武装的伊斯兰党分子于2010年5月2日清晨未发一枪一弹就长驱直入索马里海盗的主要根据地哈拉代雷镇，并占领警察局等战略要地。伊斯兰党领袖哈山?达伊尔?艾维斯（hassan dahir aweys）告诉英国广播公司，伊斯兰党要在当地实施严格的沙里亚法规来结束海盗行为。
看着这本已经将索马里所有的内战都说的一清二楚的小册子，林枫深吸一口气，他知道接下来自己所要面对的问题有多严重。
而一旁的叶尘在林枫看完之后，他也看了一下册子，之后四人面面相觑，不再说话，对于他们来说，这已经成为了他们的战争。
一场没有后援的战斗！