在新年伊始，秦阳对整个汉中的军政以及人员调度做了极大的改革。统一了军政，对军队进行重新编制。
政务方面由马元义全权负责，戏志才推荐的张鲁辅助马元义治理汉中政务。整个汉中境内减免赋税，使百姓专心务农。并且军队在训练之余开始在各地屯田生产，尽快恢复汉中因为战争而十分疲弱的实力和物资储备。
黄巾教务以及整个汉中地域的守备力量调度工作，秦阳交给了张白骑。另外将原本黄巾教麾下的三万护教军全部拨给张白骑，加上新招募的士兵。一共五万人马统一改编成汉中守备营，张白骑就任汉中守备将军一职。这个官职乃是秦阳在黄巾军内部的编制，如今的将军便相当于原本黄巾军之中的渠帅。至于大汉帝国的官职，除了秦阳必须冠名之外，其余的黄巾将领并不如何看重。
黄巾军重新整编，秦阳是黄巾军最高统领，郭嘉、戏志才为军师，加上最近投效的一些颇有谋略的谋士统统被编入黄巾军的最高统帅部。管亥任秦阳的亲卫队统领，负责最高统帅部所有成员的保卫工作。裴元绍，周仓任黄天营统领，陶升，严政任后土营统领，这两营精简之后共六万人马直接受秦阳节制。
原黑山军渠帅张燕任黑山将军，整个黑山军改编为黄巾黑山骑兵营编制三万。黄巾明王特赐予黑山军“黄巾之剑”大旗，秦阳希望将黑山军打造成一柄真正的利剑，所向披靡无往不胜！
原白波军统领彭脱，经过秦阳再三考验之后，成为新任神机营将军。神机营编制为三万，除了两千官兵负责神机弩，八千精锐弓箭手之外。秦阳又为神机营预先留下了三百霹雳车的空余位置。神机营将成为阵地阻击以及攻打坚城的利器。
另外，原本黄巾军也被秦阳重新整编。取消了原本各州黄巾军的番号，统一整编为汉中军一至五营。每营编制为三万，分别由功勋卓著的渠帅和统领担任将军。
他们分别是，黄巾军第一营将军，张牛角。第二营将军，黄龙，副将军黄邵。第三营将军，韩忠。第四营将军，马相。第五营将军，廖化。
此次廖化能够升任将军一职，也并非完全是因为秦阳对其的赏识以及他对秦阳的忠心。论军功，此次黑山白波之乱廖化功不可没，自从投效了秦阳之后在叛军上下四处奔走宣扬秦阳正统，从而直接导致最后在波才被杀之后，汉中城内四万白波军迅速瓦解投诚。而且廖化自从得到秦阳给的修炼之法后，战力增长迅速，短短时间内就堪与一些原本就是斗者的统领不相上下。鉴于廖化的功劳和实力提升速度，秦阳才力排众议，破格将廖化提升为将军一职。
被秦阳整编之后的汉中军，总数将近三十五万。这是从原本黄巾军、护教军、黑山白波军五十多万之中选拔精锐而出。各个兵种十分齐全，分工明确战力彪悍。根据秦阳的指示，原本后土营之中的老弱残兵，一概得到丰厚的经费，并且给他们在汉中各处分了土地，使他们衣食无忧。
并且挑选其中经验丰富之人，进入秦阳在汉中组建的军官学校任职。军官学校第一任校长由马元义担任，主要目的便是为了培养优秀的军事战略人才。作为有着超时代眼光的秦阳，对于人才的储备和培养自然不遗余力。
汉中整军之后，整个汉中的面貌为之一新。黄巾军操练不断，由张白骑牵头组成的兵工厂夜以继日的开炉锻造，在秦阳的一些提议之下，许多武器装备都被改进。并且秦阳还让郭嘉将兵器样品派人送到各地诸侯手中，甚至并州和汝南也不例外。
在以前，作为一个宅男的秦阳对于什么科技军工，还有物理化学之类的一概全都不精通。要是早知道能够穿越，秦阳恐怕还在吃奶的时候就开始拼命学了。所以，他很无奈的成为了最没有创意的穿越者。虽然造不出先进的武器，弄不出什么让众人赞叹的奇思妙想，但秦阳划时代的思想却也是发挥得淋漓尽致。虽然很多东西他都是依葫芦画瓢，但效果却也是十分显著的。
秦阳的目标很简单，如今曹操还在帝都闲逛，刘备兄弟三人还在幽州流浪，孙权恐怕还在吃奶，而汉中就如同是一个表面上臣服大汉的国中之国，秦阳要以完整的军工产业带动整个汉中的发展，使汉中在将来乱世到来之际，拥有整个大汉帝国之中军队最强，底蕴最深厚，牢不可破，无坚不摧足以一举统一天下的力量！
汉中城头，黄巾明王的大旗在迎着猎猎寒风飞舞。秦阳迎着风雪站在汉中城巍峨的城头之上，迎着呼啸的冷风，他仿佛看见乱世之中，身边的大旗高高飘扬，大旗所指之处，黄巾军战士嘶声怒吼，仰天咆哮。刀光剑影，无数英雄豪杰璀璨夺目。鼓角争鸣，风起云涌的乱世到来之际，秦阳绝不坐以待毙。
“天佑黄巾！黄巾万岁！汉中军万岁！”秦阳拔出佩剑昂首指天，振臂高呼。
“天佑黄巾！黄巾万岁！汉中军万岁！明王万岁！”汉中城下，数十万热血男儿发出震天怒吼，在这岁末年初之际，曾经让天下闻之丧胆的黄巾军用自己的吼声告诉世人，他们已经准备好了，黄巾明王的大旗必将席卷天下！
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写到这里，秦阳作为黄巾明王已经统一了整个汉中，本书的第一部分已经完成，接下来的故事会更加精彩。马上会开始第二卷，“帝都风云”。