在如何处置曹锟的问题上，发生了严重的意见分歧；有人主张杀，有人主张释放，有人主张监押。冯玉祥与段祺瑞、黄郛商议了数次，依然是这三种观点，无法统一。遂确定提审曹锟，依其态度而定。曹锟被士兵押进会议室，冯玉祥怒斥道：“你贿选窃位，祸国殃民，克扣军饷，世人皆曰当杀。”段祺瑞道：“你若能立即下令停战，免去吴佩孚各项职务，并自动宣布退位，则可以不杀。”曹锟惶惶道：“这三条我全部照办。”黄郛道：“那就饶你不死。”曹锟当场签署手令，满足了新政权的三项要求后，被再次囚禁。随后，冯玉祥又派遣鹿钟麟、张璧率领一队卫士，到故宫与溥仪谈判，迫使溥仪及其嫔妃迁出故宫，退居摄政王府。
与此同时，吴佩孚在山海关外督战，面对全线失利的局面，惟有艰难支撑。他亲率僚属赴九门口督战，前线兵将闻知，士气转旺，战局颇有转机。忽见日籍顾问冈野匆匆赶来，呈上一份电文。吴佩孚接手一看，神色大变。电文称：“冯玉祥等于昨日退出战场，未经枪战即攻入北京，发动政变。曹锟总统已失去自由，内阁官员全部被囚禁。”吴佩孚双眼死死盯着电报，细看所列之叛变者名单，全是多年来追随在左右的直系将领，不由得怒火上窜，两眼发黑，差点晕倒在地。过了半晌，他逐渐稳定神色，带领随从赶回总司令部。
吴佩孚，字子玉，山东蓬莱人。生的长脸隆额，白面红髭；两眉入鬓，高鼻悬胆；秀才出身，智略过人。青年时加入淮军，旋即改投袁世凯新军，在曹锟麾下历任连长、营长、团长等职。护法战争期间，随曹锟迎战蔡锷；于枪林弹雨中救了曹锟一命，遂得到曹锟的大力提携而步步高升。在北洋系统内部，曹锟之憨厚与吴佩孚之精明，可谓天生绝配；曹锟之粗鲁与吴佩孚之文雅又相得益彰。在多年的征战岁月中，凡吴佩孚之谋略，曹锟无不言听计从。二人之差别在于，曹锟极为贪财，吴佩孚却非常清廉。二人唯一的政见分歧是：曹锟贿选总统，吴佩孚极力反对；未能达成一致，终于出现裂痕；但却丝毫不影响曹锟对吴佩孚之信赖，亦不影响吴佩孚对曹锟之忠诚。吴佩孚此次挂帅出征，督战关外，原想一鼓荡平奉军，谁料战况不利，大有难以招架之势。忽接北京来电，得知冯玉祥反叛，老巢被端，后路被断。吴佩孚五内如焚，匆忙赶回总司令部。何以见得，有诗为证。诗曰：
一纸电报重如山，千军统帅方寸乱。兵家奇谋抄后路，人生最怕中暗箭。
吴佩孚回到总部，立即召开紧急军事会议，各高级将领全部出席。吴佩孚以极为沉痛地语气宣布了北京政变的消息，与会将领无不大惊失色。接着，吴佩孚宣布总退却计划，将残余兵力分为三大防御体系：秦皇岛一线由张福来负责防守，昌黎一线由彭寿莘负责防守，滦州一线由靳云鹏负责防守。安排完防御计划，吴佩孚顿感身心极度疲惫，连夜带领一团卫队，登上专列，星夜疾驰，返回天津。
主帅逃跑，直系军心大乱。相反，奉系部队则士气空前高涨，全面发起猛烈进攻。此时，奉系悍将张宗昌成了战场上的骄儿。张宗昌所领的部队是一支典型的杂牌军，其中收留有大量的日本、朝鲜、法国、白俄军人，虽然漫无军纪，但却凶残善战。张作霖把张宗昌摆在最前线，本意是让他当炮灰，想不到却成全了他。张宗昌率领这支近两万人的杂牌军实施中路突破，一阵猛打猛冲，击溃了直军董国政的昌黎防线，一举攻占了冷口，兵锋直逼建昌大营。防守建昌的直军胡景翼部临阵倒戈反叛，与张宗昌合兵一处，挥兵打下滦州，把直军截成两段。与此同时，奉军吴光新部占领海阳，列炮猛轰秦皇岛；张学良又率部从长城口杀出，加上张宗昌部由滦州挥师南下，直军便处在奉军的三面包围之中。
俗话说：兵败如山倒。处在包围中的直军彻底丧失斗志，纷纷丢弃阵地，狼奔兔窜，仓皇逃命。枪支、大炮、弹药扔得漫山遍野，粮食、被服、帐篷充斥道路两旁。奉军乘胜追击赶杀，枪击刀劈，沿途毙伤无数；人喊马叫，势如狂涛汹涌。大战数日，直军的三道防线全部土崩瓦解。
10月30日，奉军三路并进，攻占秦皇岛。除少部分直军乘轮船从海上逃跑外，其余二万多人被缴械投降。次日，山海关外的直军全部逃离阵地，麇集在车站。不料，入关的铁路已被炸断，火车不能开动。败兵又逃向秦皇岛，被迎面而来的奉军重重包围，近三万人马全部当了俘虏。
奉军连连获胜，张作霖大喜，命令各部：“火速入关，捉拿吴佩孚。”此时，山海关内至唐山一带的直军已全部放弃抵抗。奉军则以吴光新的骑兵师为先锋，一路势如破竹，呼啸而进。各路奉军紧随其后，大队人马，长驱入关。攻古冶、占芦台、陷塘沽，一路穷追猛打，战无不胜；只用了五天的时间，便兵临天津城下。直军完全陷入奉军和冯玉祥军的大包围之中。
困守天津的吴佩孚眼见大势已去，率残部两千余人乘舰逃往武汉。次日，奉军吴光新、张宗昌两部杀入天津；随后，奉军大队纷纷抵达；在天津的直军残余部队全被缴械。
第二次直奉战争到此结束。此次大战，直军败得太惨，前后不到两个月，二十万大军烟消云散，吴佩孚做梦也想不到会是这般结局。这才是：直奉大战天地暗，胜败全在弹指间。皆因冯部闹政变，老巢被抄全局乱。要知后事如何，且听下回分解。